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医学部 生理学講座 生物物理学部門

研究者リスト >> 柴山 修哉
 

柴山 修哉

 
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研究者氏名柴山 修哉
 
シバヤマ ナオヤ
URLhttp://www.jichi.ac.jp/divbio/index.html
所属自治医科大学
部署医学部生理学講座生物物理学部門
職名教授
学位工学博士(大阪大学)
科研費研究者番号20196439
J-Global ID200901080671475544

研究キーワード

 
ヘモグロビン ,Hemoglobin ,アロステリー ,Allostery ,X線結晶構造解析 ,ゾル・ゲル法 ,Sol-gel ,Protein folding

研究分野

 
  • ライフサイエンス / 生物物理学 / 
  • ライフサイエンス / 構造生物化学 / 

経歴

 
 
   
 
自治医科大学(JMU)  教授 
 

学歴

 
 
 - 
1985年
大阪大学 基礎工学研究科 物理系専攻 生物工学分野
 
 
 - 
1985年
大阪大学  
 
 
 - 
1983年
大阪大学 基礎工学部 生物工学科
 
 
 - 
1983年
大阪大学  
 

委員歴

 
2010年1月
 - 
現在
日本生物物理学会  分野別専門委員(アロステリズム)
 

論文

 
 
Artoni Kevin R Ang   Yasufumi Umena   Ayana Sato-Tomita   Naoya Shibayama   Naohisa Happo   Riho Marumi   Yuta Yamamoto   Koji Kimura   Naomi Kawamura   Yu Takano   Tomohiro Matsushita   Yuji C Sasaki   Jian Ren Shen   Kouichi Hayashi   
Journal of synchrotron radiation   30(Pt 2) 368-378   2023年3月
X-ray fluorescence holography (XFH) is a powerful atomic resolution technique capable of directly imaging the local atomic structure around atoms of a target element within a material. Although it is theoretically possible to use XFH to study the ...
 
Nagatomo, S   Shoji, M   Terada, T   Nakatani, K   Shigeta, Y   Hirota, S   Yanagisawa, S   Kubo, M   Kitagawa, T   Nagai, M   Ohki, M   Park, S.-Y   Shibayama, N   
Biophys. J.   121(14) 2767-2780   2022年6月   [査読有り]
 
Naoki Yamamoto   Jiro Kikuchi   Yusuke Furukawa   Naoya Shibayama   
PLOS ONE   17(5) e0261699-e0261699   2022年5月
We report expression and purification of a FLT3 protein with ITD mutation (FLT3-ITD) with a steady tyrosine kinase activity using a silkworm-baculovirus system, and its application as a fast screening system of tyrosine kinase inhibitors. The FLT3...
 
Naoki Yamamoto   Maiko Kofu   Kenji Nakajima   Hiroshi Nakagawa   Naoya Shibayama   
The Journal of Physical Chemistry Letters   12(xxxx) 2172-2176   2021年2月   [査読有り]
Hydration water plays a crucial role for activating the protein dynamics required for functional expression. Yet, the details are not understood about how hydration water couples with protein dynamics. A temperature hysteresis of the ice formation...
 
Naoya Shibayama   Ayana Sato-Tomita   Mio Ohki   Kouhei Ichiyanagi   Sam-Yong Park   
Proceedings of the National Academy of Sciences   117(9) 4741-4748   2020年3月   [査読有り]
Hemoglobin is one of the best-characterized proteins with respect to structure and function, but the internal ligand diffusion pathways remain obscure and controversial. Here we captured the CO migration processes in the tense (T), relaxed (R), an...

MISC

 
 
Artoni Kevin R. Ang   Ayana Sato-Tomita   Naoya Shibayama   Yasufumi Umena   Naohisa Happo   Riho Marumi   Koji Kimura   Tomohiro Matsushita   Kazuto Akagi   Takahiko Sasaki   Yuji C. Sasaki   Kouichi Hayashi   
Japanese Journal of Applied Physics   59(1)    2020年1月
X-ray fluorescence holography (XFH) is a technique that can directly image the 3D arrangement of atoms around an element in a sample. The holograms contain both intensity and phase information, allowing atomic reconstruction without needing prior ...
 
Toshiyuki Chatake   Andrii Y. Kovalevsky   Naoya Shibayama   SamYong Park   Takuya Ishikawa   Marat Mustyakimov   Paul Langan   Yukio Morimoto   
IUCr2008 Satellite symposium      2008年   
 
SY Park   N Shibayama   T Hiraki   JRH Tame   
BIOCHEMISTRY   43(27) 8711-8717   2004年7月   
A number of ligand binding studies of human adult hemoglobin (HbA) cross-linked between Lys 82beta(1) and Lys 82beta(2) with bis(3,5-dibromosalicyl)fumarate have been reported. The oxygen binding properties of native HbA, including the cooperativi...
 
S Saigo   N Shibayama   
BIOCHEMISTRY   42(32) 9669-9676   2003年8月   
Theory and simulations predict that the folding kinetics of protein-like heteropolymers become nonexponential and glassy (i.e., controlled by escape from different low-energy misfolded states) at low temperatures, but there was little experimental...
 
S Adachi   SY Park   JRH Tame   Y Shiro   N Shibayama   
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   100(12) 7039-7044   2003年6月   
Human Hb, an alpha(2)beta(2) tetrameric oxygen transport protein that switches from a T (tense) to an R (relaxed) quaternary structure during oxygenation, has long served as a model for studying protein allostery, in general. Time-resolved spectro...

講演・口頭発表等

 
 
富田文菜   佐藤篤志   野澤俊介   星野学   野口大貴   朴三用   柴山修哉   腰原伸也   足立伸一   足立伸一   
物構研サイエンスフェスタ要旨集   2013年   
 
柴山修哉   
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   2012年5月31日   
 
 
小嶋翔平   赤崎秀治   柴山修哉   関根晃陽   比留間航   山本慎一郎   袴田航   朴三用   西尾俊幸   奥忠武   
日本農芸化学会大会講演要旨集   2009年3月5日   
 
茶竹俊行   石川卓哉   KOVALEVSKYI   Andrii Y   柴山修哉   PARK Sam‐Yong   MUSTYAKIMOV Marat   LANGAN Paul   森本幸生   
京都大学原子炉実験所学術講演会報文集   2008年1月   

担当経験のある科目(授業)

 
 
   
 
物理学概論 (自治医科大学)
 
   
 
生命科学1,2 (自治医科大学医学部)
 
   
 
物理学 (自治医科大学付属看護短期大学)
 
   
 
生物化学 (法政大学生命科学部)
 
   
 
基礎臨床統合講義 (自治医科大学医学部)

所属学協会

 
 
   
 
American Society of Biochemistry and Molecular Biology
 
   
 
日本生化学会
 
   
 
日本生物物理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

 
 
3つのレーザー励起によるX線1分子追跡法を用いたヘモグロビン動態の全貌決定
日本学術振興会: 科学研究費助成事業
佐々木 裕次 関口 博史 柴山 修哉 
研究期間: 2020年4月 - 2023年3月
 
ヘモグロビン結晶構造の半網羅的機能決定
日本学術振興会: 科学研究費助成事業
柴山 修哉 
研究期間: 2019年4月 - 2023年3月
 
働く最中のヘモグロビン分子内動態の原子レベル追跡
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(C))
柴山 修哉 
研究期間: 2016年4月 - 2019年3月
 
バイオロジーにおける3D活性サイト科学
文部科学省: 科学研究費補助金(新学術領域研究)
佐々木 裕次 
研究期間: 2014年7月 - 2019年3月
 
ヘモグロビンの四次構造変化を許容する結晶を用いた時分割構造解析法の開拓
文部科学省: 科学研究費補助金(新学術領域研究)
柴山 修哉 
研究期間: 2015年4月 - 2017年3月